DYCP-31DN-järjestelmä on vaakasuuntainen elektroforeesijärjestelmä. Vaakasuuntaisessa geelielektroforeesissa geeli valetaan vaakasuoraan ja upotetaan juoksupuskuriin geelilaatikon sisällä. Geelilaatikko on jaettu kahteen osastoon, joista kaksi erottaa agaroosigeeli. Kuten aiemmin todettiin, anodi sijaitsee toisessa päässä, kun taas katodi sijaitsee toisessa. Ioninen käyntipuskuri mahdollistaa varausgradientin luomisen, kun virtaa käytetään. Lisäksi puskuri jäähdyttää geeliä, joka lämpenee latauksen aikana. Käyntipuskuria kierrätetään usein uudelleen pH-gradientin muodostumisen estämiseksi. Käytettävissämme on erikokoisia kampakampoja. Eri kammat tekevät tästä horisontaalisesta elektroforeesijärjestelmästä ihanteellisen kaikkiin agaroosigeelisovelluksiin, mukaan lukien vedenalainen elektroforeesi, nopeaan elektroforeesiin pienillä näytemäärillä, DNA:lla, sukellusveneelektroforeesilla, DNA:n tunnistamiseen, erottamiseen ja valmistukseen sekä molekyylipainon mittaaminen.
Elektroforeesin aikana valukaukaloon muodostuu geeli. Alusta sisältää pieniä "kuoppia", jotka pitävät testattavat hiukkaset. Useita mikrolitraa (µL) liuosta, joka sisältää testattavat partikkelit, ladataan huolellisesti kuoppiin. Sitten puskuri, joka johtaa sähkövirtaa, kaadetaan elektroforeesikammioon. Seuraavaksi valualusta, joka sisältää hiukkaset, asetetaan varovasti kammioon ja upotetaan puskuriin. Lopuksi kammio suljetaan ja virtalähde kytketään päälle. Sähkövirran synnyttämä anodi ja katodi vetävät puoleensa vastakkaisesti varautuneita hiukkasia. Hiukkaset liikkuvat hitaasti geelissä kohti vastakkaista varausta. Virta katkaistaan, geeli otetaan pois ja tarkastetaan.