Geelielektroforeesi voidaan suorittaa joko vaaka- tai pystysuunnassa. Pystysuorat geelit koostuvat yleensä akryyliamidimatriisista. Näiden geelien huokoskoot riippuvat kemiallisten komponenttien pitoisuudesta: agaroosigeelihuokoset (halkaisija 100 - 500 nm) ovat suurempia ja epäyhtenäisempiä kuin akryyliamidigeelihuokoset (halkaisijaltaan 10 - 200 nm). Vertailun vuoksi DNA- ja RNA-molekyylit ovat suurempia kuin lineaarinen proteiinijuoste, jotka usein denaturoituvat ennen tätä prosessia tai sen aikana, mikä tekee niistä helpompia analysoida. Siten proteiinit ajetaan akryyliamidigeeleillä (pystysuoraan). DYCZ – 24DN on minikaksoispystyelektroforeesi, jota voidaan käyttää SDS-PAGE:lle ja natiivi-PAGE:lle. Sen tehtävänä on valaa geelejä alkuperäiseen asentoonsa erityisellä geelivalulaitteellamme.
